Една от целите на провежданата от ЦКС политика бе преструктуриране на кооперативната промишленост и оптимизиране на осъществяваните дейности. Отчитайки поставените от ЕС високи хигиенни и технологични изисквания към производителите на храни и значителните по размер инвестиции за тяхното достигане, бе оценена необходимостта от диверсификация на произвежданите продукти, водеща до производство на конкурентни и рентабилни продукти. Оценено бе местното и национално значение на всяка една дейност, като хлебопроизводството бе определено за приоритетна промишлена дейност в рамките на системата. Определянето на приоритет бе от съществено значение за успешното провеждане на единна инвестиционна и технологична политика, чрез която хлебопроизводството да покрие високите изисквания за работа в рамките на ЕС.

          Отчитайки европейските и национални тенденции в производството на основни типове хляб, пазарните позиции на големите производители в страната и постоянно намаляващите обеми на това производство в кооперативната система, от 2004 г. ЦКС започна реализирането на проект за преструктуриране и оптимизиране на хлебопроизводството. Проектът предвижда обособяване на районни центрове за хлебопроизводство, които да бъдат модернизирани според изискванията на ЕС и добрите хигиенни и производствени практики, като произведената продукция преимуществено се реализира в кооперативната търговска мрежа.

          По време на преустройството бяха направени значителни промени в типа на горивото, което се използва в кооперативните хлебопекарни. Докато в началния период съотношението между твърдото и течно гориво към електроенергията беше 3:1, в края на 2006 г. съотношението вече е 2.7:1 в полза на ел. енергията и газта. Това показва, че преобладаващата част модернизираните хлебопекарни са преминали към използването на по-евтино и екологично гориво.

          За 2006 г., районните центрове за хлебопроизводство са произвели 18 345 тона хляб, или 88% от производството в кооперативната система (20 885 тона). Аналогичен е и относителният дял на формираните от тях приходи - 71% спрямо общите приходи от хлебопроизводство.

          Анализът на рентабилността на хлебопроизводството в районните центрове показва, че в 46 от тях дейността е печеливша, като отчетената за 2006 г. печалба е в размер на 305 хил.лв.